Masjid ini didominasi warna putih, karena nama Thohir sendiri memiliki arti suci, bersih. Selain itu, terdapat empat menara setinggi 40 meter melambangkan 4 arah mata angin: utara, timur, selatan, dan barat, menggambarkan bahwa Islam bisa dipandang dari seluruh arah dan menjadikan rahmatan lil ‘alamin untuk semua.